從實驗室工作流程來看，微生物實驗室可分為樣品保存、樣品前處理、過程分析、清洗滅菌四個流程，不同的工作流程需要不同的儀器。

一、樣品保存
1、 超低溫冰箱：低溫保存疫苗、菌種、生物樣本等
2、 液氮罐：長期活性保存疫苗、菌毒種、細胞
3、 藥品冷藏箱：用于冷藏保存藥品、試劑、生物制品和疫苗
二、樣品前處理
1、 移液器：定量轉移液體的器具
2、 離心機: 液固或液液顆粒分離
3、 凍干機: 凍結的水分子直接升華水蒸氣
4、 均質儀: 提取樣品中DNA/RNA/蛋白質
5、 培養(yǎng)箱: 培養(yǎng)微生物、植物和動物細胞
6、 生物安全柜: 實驗操作中空氣凈化負壓安全裝置
7、 超凈工作臺: 局部工作區(qū)域潔凈度

三、過程分析
1、 PCR儀：用于傳染病的診斷、基因復制以及親子鑒定
2、 酶標儀：酶聯(lián)免疫吸附試驗的專用儀器
3、 核酸提取儀：核酸提取試劑自動完成樣本核酸提取
4、 暗箱式紫外分析儀：于核酸、蛋白電泳凝膠，薄層層板結果的觀察分析
5、 電泳儀：用于DNA 測序
四、清洗滅菌
1、 高壓滅菌鍋：實驗前后殺菌
2、超聲波清洗機：清洗實驗器具及玻璃器皿
使用微生物檢測儀的檢測方法就比較簡單了。

1、開機預熱，30秒后即進入工作狀態(tài)；

2、將一體化試劑采樣棉簽棒從超凈管中拔出準備采樣；

3、對被測物進行采樣；

4、采樣完后放進超凈管中旋緊密封；

5、按壓一體化試劑棒頂部使密封腔內試劑自動流入超凈管中與棉簽棒上標本發(fā)生ATP反應；

6、按壓儀器頂部橙黃色按鈕使試劑艙蓋自動彈開；

7、將正在發(fā)生反應的一體化試劑插入儀器試劑艙接受檢測；

8、經過十幾秒檢測時間儀器完成標本檢測，自動顯示、存儲、傳輸ATP檢測結果。